O Convento de São João de Deus foi construído na cidade de Elvas no ano 1645 para servir como Hospital Militar, para socorrer os militares doentes e feridos no âmbito da Guerra da Restauração. Foi construído segundo a ordem de D. João IV para construir hospitais militares nas principais praças do país, tornando-se o primeiro convento da ordem erguido em Portugal.
Embora o edifício tenha sido ampliado em 1653, sempre foi pequeno em comparação com o número de feridos que ajudou.
Em 1659, ano da Batalha das Linhas de Elvas, 10 religiosos poderiam servir 350 feridos. O hospital militar esteve ativo até 1976, ano em que o edifício foi abandonado até ser restaurado, em 2004, para se tornar no Hotel São João de Deus.
A igreja do convento foi construída ao lado de uma das torres da muralha fernandina. O resto do templo é bastante simples e está fechado para o culto.
Largo João de Deus, 1, Elvas.
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